Ежегодно в летний период специалисты санитарной службы региона проводят лабораторный контроль качества воды и почвы в местах массового отдыха и купания населения. Мониторинг осуществляется в Горно-Алтайске, Майминском, Турочакском, Онгудайском, Усть-Коксинском, Чемальском, Кош-Агачском и Чойском районах.
Под контролем находятся реки, озера и пруды, традиционно используемые жителями и туристами для отдыха.
В течение всего летнего сезона вода и почва прибрежных зон исследуются по микробиологическим, паразитологическим, вирусологическим и санитарно-химическим показателям. В июне в рамках мониторинга было отобрано 57 проб воды.
По результатам исследований в одной пробе воды из реки Катунь выше села Усть-Кокса выявлены обобщенные колиформные бактерии и кишечная палочка, что свидетельствует об органическом загрязнении. При этом все исследованные пробы почвы с прибрежных территорий соответствовали санитарным требованиям по микробиологическим и паразитологическим показателям.
Жителям и гостям региона рекомендуется выбирать для отдыха и купания только официально разрешенные места, имеющие необходимые документы и санитарно-эпидемиологические заключения. Такие зоны оборудованы, находятся под контролем и обеспечивают безопасность отдыхающих.
В настоящее время положительные санитарно-эпидемиологические заключения выданы пляжу «Рублевка» в Чемальском районе, пляжу «Еланда» в Горно-Алтайске и пляжу «Манжерок» на территории ВК «Манжерок».